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科研进展 | 三峡水库沉积物中原核生物群落组成垂直变化及共现模式
发布时间:2023-09-27 | 发布人:河库生态协同创新中心
中心在三峡水库沉积物中原核生物群落组成研究中取得新进展。
论文ID
论文原名:Vertical variation in prokaryotic community composition and co-occurrence patterns in sediments of the Three Gorges Reservoir, China
论文译名:三峡水库沉积物中原核生物群落组成垂直变化及共现模式
发表期刊:Environment Research
IF:8.3
发表时间:2023.8
DOI号:10.1016/j.envres.2023.116927
古菌和细菌分布在整个沉积物中,但对其生物多样性、群落组成及相互作用的了解还局限于表层(0-20 cm)。本研究从三峡水库(世界上最大的水库之一)的3个垂直沉积物剖面(深度为0-295 cm)采集了沉积物样品。16S rRNA测序显示不同沉积物之间的微生物多样性没有显著差异。然而,在沉积物垂直剖面上,古菌和细菌群落的相似性随距离的增加而有所下降。非度量多维标度分析(NMDS)显示,古菌和细菌群落可明显分为两组,分别位于上层沉积物(0-135 cm)和深层沉积物(155-295 cm)。同时,在垂直剖面的精细尺度上,优势古菌(如广古菌门)和细菌(如变形菌门)的相对丰度发生了显著变化。LEfSe分析表明,上层沉积物和深层沉积物中存在24种细菌和26种古菌生物标志物。每一层都有不同的微生物区系,这表明具有不同生物功能的微生物能够沿着沉积物剖面生长和繁殖。共现网络分析进一步表明,上层沉积物的微生物网络比深层沉积物的微生物网络更为复杂。此外,新发现的厌氧甲烷氧化古菌Candidatus Methanoperedens被鉴定为两个沉积层中最丰富的关键古菌类群,突出了甲烷氧化在三峡水库生态系统物质循环中的重要性。综上所述,本研究调查了整个垂直沉积物剖面中底栖微生物群落的生物多样性和共存模式,为典型深水水库生态系统中古菌和细菌群落的垂直分布提供了详细的见解。
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